①开诊所方面:中医专长医师证考到可以直接开诊所，而确有专长证只作为报考助理医师的凭据，相当于毕业证。
②处方权方面:中医专长医师证有处方权，而确有专长证没有处方权。
③考核方面:中医专长医师证书以专家评议方式考核，而确有专长证书还是传统的先考实践技能再考笔试。
④考执业医师方面:中医专长医师证取得5年后可考中医执业医师，而确有专长证书需要先考助理医师，助理医师通过5年后才能考执业医师。助理医师没有处方权，而且只有在执业医师的指导下，才能行医。也就是说通过确有专长证书报考助理医师、再报考执业医师的同学，只有在3个考试都通过后，取得《中医执业医师》证，才有独立处方权。最快是8年。
①开诊所方面:中医专长医师证考到可以直接开诊所，而确有专长证只作为报考助理医师的凭据，相当于毕业证。
②处方权方面:中医专长医师证有处方权，而确有专长证没有处方权。
③考核方面:中医专长医师证书以专家评议方式考核，而确有专长证书还是传统的先考实践技能再考笔试。
④考执业医师方面:中医专长医师证取得5年后可考中医执业医师，而确有专长证书需要先考助理医师，助理医师通过5年后才能考执业医师。助理医师没有处方权，而且只有在执业医师的指导下，才能行医。也就是说通过确有专长证书报考助理医师、再报考执业医师的同学，只有在3个考试都通过后，取得《中医执业医师》证，才有独立处方权。最快是8年。